论军屯问题时候看到的一样。
他在奏疏中称：“各所屯军,视武弁皆世受统辖之人,自非破裂身家死生在俄顷,谁肯危言正色讦发其奸,以取反噬之祸乎?若其同为僚属,则更相遮护,所至皆然。”
仅凭朝廷的一纸诏书就想使得他们将私自役使的军士交出来，将侵占的田亩的加以清丈起科，无异于痴人说梦。在朱载坖的严令之下，魏国公徐鹏举退出了近四千被他私自役使的军士，应天以及附近州县的田亩也开始顺利的清丈了。
南直隶的士绅地主们见连魏国公这样的国朝勋臣都不得不为新政让路，其余的地主们也就基本上偃旗息鼓，不敢和朝廷对抗了，朱载坖严令浙直各道、府、州县，尽快清丈田亩，编撰成册，日后有田地买卖等，必须及时变更，每五年由朝廷组织，进行田亩的清丈工作。
同时提督海关衙门户部左侍郎兼兵部左侍郎胡宗宪也奉诏到南京面圣，朱载坖也当即召见他，询问有关海关的事情。